Проф. Емануил Иванов е роден през 1857 г. в Свищов, в авторитетно възрожденско семейство. Завършва математика и физика в Политехниката в Мюнхен. Става учител, началник на отдел и главен инспектор в Министерството на народното просвещение, един от създателите на Софийския държавен университет и негов ректор три години (1890/91, 1891/92, 1893/94 г.)
Създава основите на преподаване на висша математика в България, както и българското физико-математическо дружество. Редовен член на Българската академия на науките.
Чете лекциии по висш анализ, диференциално смятане, диференциални уревнения, интегрално смятане, въведение в теорията на комплексните функции, теория на функциите, елиптични интеграли и функции, елементарна математика.
Има публикувани научни трудове по теория на числата, алгебра, анализ, методика на обучението по математика.
В Министерството на просвещението подкрепя всекиго, у когото вижда желание за работа, за самоусъвършенствуване, за творчество. Не се бои, че негови ученици един ден може да го надминат в научно отношение. Защото не разчита на невежеството, на недостатъчната подготовка на другите, за да изглежда по-учен от тях. Това качество го издига на недосегаема висота.
Последните си години живее в Кюстендил, където умира в 1925 г.
Погребан е близо до дядо Ильо войвода.
Природоматематическата гимназия носи името му от 1992 г.